天文、氣象十四世紀中葉的《白猿獻三光圖》載有132幅云圖 ， 并與天氣變化聯系起來 ， 絕大部分與現代氣象學原理相一致 。(歐洲到1879年才出版只有十六幅的云圖 。)1383年南坤輿萬國全圖京設京師觀象臺 ， 1439年造渾天儀置北京(1900年被八國聯軍德國劫走 ， 1921年索回 ， 置南京紫金山天文臺) 。1442年 ， 北京設觀象臺 。1446年 ， 建晷影堂(位于北京古觀象臺西南側) 。1607年 ， 李之藻撰《渾蓋通憲圖說》刊行 。1617年 ， 張燮著《東西洋考》記載海洋占候等的詳細資料 。1634年 ， 正式安裝中國第一架天文望遠鏡：“筩”(yong) 。1643年 ， 出版《崇禎歷書》 。
數學、物理1450年 ， 吳敬撰《九章算法比類大全》 。1524年 ， 王文素著成54卷總計1500多問近50萬字《新集通證古今算學寶鑒》 。1584年 ， 朱載堉著《律呂精義》出版 。1592年 ， 程大位撰《算法統宗》最早記載使用珠算方法開平方和開立方 。1606年 ， 徐光啟與利瑪竇開始合譯《幾何原本》 。1613年 ， 李之藻據西人克拉維斯《實用算術概論》和中國程大位《算法統宗》編譯而成《同文算指》 。1637年 ， 宋應星在《論氣·氣聲》中對聲音的產生和傳播作出了合乎科學的解釋 ， 認為聲音是由于物體振動或急速運動沖擊空氣而產生的 ， 并通過空氣傳播 ， 同水波相類似 。方以智在《物理小識》卷2中提出：“宙(時間)輪于宇(空間) ， 則宇中有宙 ， 宙中有宇 。”提出了時間和空間不能彼此獨立存在的時空觀 。在《物理小識》卷1中正確地解釋了蒙氣差(即大氣折射)現象 。民間光學儀器制造家孫云球制造放大鏡、顯微鏡等幾十種光學儀器 ， 并著《鏡史》(已佚) 。
醫學
李時珍紀念郵票1406年 ， 朱棣等主持收集編成《普濟方》(載方六萬一千七百三十九個 ， 是中國現存最大的一部醫方書) 。1567年在寧國府太平縣試行中國人痘接種方法預防天花 。(種痘預防天花是人工免疫法的開端 ， 十七世紀中國種痘技術已相當完善 ， 并已推廣到全國 。中國種痘法于十七世紀初傳入歐洲) 。1596年李時珍著《本草綱目》在南京正式出版刊行 ， 同期問世的還有《瀕湖脈學》《奇經八脈考》等 。1601年 ， 楊繼洲著《針灸大成》 。
1617年 ， 陳實功收集了大量有效方劑 。他注重實踐 ， 勇于革新 ， 創造性地進行了截趾(指)、氣管縫合等外科手術 。著有《外科正宗》 ， 書中對一些腫瘤也作了論述 。1624年 ， 張景岳撰《類經》刊行 ， 同年 ， 再編《類經圖翼》和《類經附翼》 。1640年 ， 《景岳全書》64卷成書 。1641年 ， 吳有性撰《瘟疫論》 。王夫之在《思問錄·外篇》中提出了關于生物體的新陳代謝的觀念 ， 他說：“質日代而形如一 ， ……肌肉之日生而舊者消也 ， 人所未知也 。人見形之不變而不知其質之已遷 ， ……”
農學1376年 ， 俞宗本著《種樹書》(記載了多種樹木的嫁接方法 ， 如桃、李、杏的近緣嫁接和桑、梨的遠緣嫁接等) 。1406年 ， 朱橚《救荒本草》問世(收集四百一十四種可供食用的野生植物資料 ， 載明產地、形態、性味及其可食部分和食法 ， 并繪有精細圖譜) 。1547年 ， 馬一龍著《農說》(記載了水稻的精耕細耘、密植、育苗、移栽等的種植經驗 ， 是中國第一部運用哲學觀點來闡述農業技術的著作) 。1596年 ， 屠本畯(jun)著中國現存最早的海洋生物專著《閩中海錯疏》(記載了沿海一帶以海生無脊椎動物和魚類為主的二百多種水族生物的形態和生活習性等) 。1608年 ， 喻仁、喻杰合著《元亨療馬集》(著名的獸醫學著作 ， 內容包括對馬、牛和駱駝的治療經驗 ， 現今仍有實用價值) 。1617年 ， 趙蛹著《植品》(有關西紅柿的種植技術等) 。1628年 ， 徐光啟撰《農政全書》 。
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