MALT淋巴瘤一般通過放療、化療等方法進行治療 。
MALT淋巴瘤最常發生的部位是胃，胃原發MALT淋巴瘤與幽門螺桿菌的感染相關，所以抗幽門螺桿菌治療可以使2/3的局限期胃MALT淋巴瘤達到完全的緩解 。但是遠期復發是需要注意的問題，所以應該長期隨訪 。對于局限期的胃MALT淋巴瘤抗幽門螺桿菌治療無效或者有效后復發者，可以行胃及周圍淋巴結放療，可以達到治愈的效果，并且能夠保留胃的功能 。局部放療失敗后的患者，可以考慮全身化療，或者加上利妥昔單抗靶向治療 。如果上述治療均無效果，局限期患者應該選擇外科手術切除 。晚期的患者臨床并不常見，治療原則與濾泡淋巴瘤相似，一般采用化療，特殊情況下可以考慮局部放療 。
MALT淋巴瘤可發生在眼眶、腸、肺、膀胱、腎臟和中樞神經系統，有時表現為常規影像學檢查發現的新生兒腫塊，或一些局部癥狀 。如胃淋巴瘤的上腹部不適，約40%的患者累及淋巴結和鄰近器官 。也可能發生遠處轉移，尤其是在轉化為彌漫性大B細胞淋巴瘤后 。許多發展為這種淋巴瘤的患者有自身免疫或炎癥過程，如干燥綜合征、橋本甲狀腺炎或幽門螺桿菌性胃炎 。
MALT淋巴瘤患者的飲食應清淡易消化，主要是高熱量、高蛋白和富含維生素的食物，比如谷物、豆類、蔬菜和水果 。患者可以在日常生活中飲用適量的水，這有利于促進體內代謝廢物的排出 。注意食物衛生，飯前洗手飯后漱口，可以用軟牙刷清潔口腔 。
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