中后期管理
管理中后期應形成干濕交替的環境 。從原基的形成到耳芽的出現需要7天的時間 。噴水3-5次 ， 每次15-20分鐘 ， 保持濕度在85%以上 。當穗芽直徑達到0.5cm ， 棚內溫度在22℃以上時 ， 白天應加強通風 ， 并覆蓋遮陽網 。當幼穗整齊并逐漸增多時 ， 應停止澆水 ， 并打開所有遮陽棚 。袋上的孔全部打完后 ， 根據情況將袋暴露在陽光下3-4天 ， 菌絲體再次愈合后再噴水 。當溫度達到25度時℃ 白天 ， 溫室四周和頂部的塑料薄膜和遮陽網全部打開 ， 夜間噴水時間延長 。
疾病控制
當果穗芽長到1.5厘米時 ， 用0.3%濃度的鹽溶液或結合澆水 ， 每4天噴一次子實體 ， 以防穗腐病、線蟲病和真菌感染 。在黑木耳的整個生長周期中 ， 最好用10000~12000gs強而高效的磁化劑磁化水對黑木耳進行噴施 ， 使黑木耳達到無公害或綠色產品的標準 。
采摘
當穗片全部膨大 ， 直徑2.5～3cm時 ， 可集中收獲 。收割時 ， 要留大的和小的 ， 收割后停止澆水 ， 待新的耳芽形成后繼續噴水 。
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