所以在雄性蚊子進食時，會幫助植物進行傳粉 。在一些地區中，蚊子在植物授粉中起主要作用，且蚊子的授粉能力不會比蜜蜂和蝴蝶差 。如果消滅了所有蚊子，那么依賴它們授粉的植物會受到巨大的影響 。蒼蠅在生態系統的作用許多物種都以蒼蠅為食據統計，1只蟾蜍在1小時內竟吞食15只鮮活蒼蠅1只燕子在1個夏季里就能吃掉50萬到100萬只蒼蠅蚊還有蜻蜓甲蟲螨蜘蛛黃蜂許多鳥類等都是以蒼蠅作為食物甚至植物也吃蒼蠅，如捕蠅草豬籠草等 。
如果地球上沒有蒼蠅，許多物種將減少甚至滅絕，這將嚴重破壞地球的生態平衡 。一些能幫助植物授粉的蒼蠅，也會吸取自然界的花蜜，給植物授粉 。例如，在臺灣省南部，金蠅承擔著傳播花粉的重任 。沒有他們的幫助，芒果的產量和質量都會下降 。幼蟲是生態系統中的分解者 。蒼蠅的幼蟲，也就是蛆，分解自然界中無數的糞便、尸體和各種有機廢物，保證了生態系統的正常運轉 。
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