酸菜老師講過，挑、圈、聯(lián)、靠四字訣，是架構(gòu)起生信文章分析的四大標準模塊 。這其中，挑即表達差異，指的是從高通量數(shù)據(jù)分析得到差異分子列表的數(shù)據(jù)處理過程 。
在高通量檢測這個領(lǐng)域中，基因芯片是當(dāng)仁不讓的扛把子，是了解基因組結(jié)構(gòu)和功能的絕佳利器 。生物大數(shù)據(jù)之所以這么紅火，就是因為有芯片為科研者提供了海量數(shù)據(jù)來做支撐，唯有如此，科研者們才能深挖數(shù)據(jù)得到有用的信息 。
因而，在《生信體系課-上篇》的第一個段位中，對芯片數(shù)據(jù)的來源和下載的具體闡釋，就成為了第一個知識模塊 。其中，第一課所講解的就是芯片（特別是表達譜芯片）的基礎(chǔ)知識 。
01
基因芯片，是固定在某種介質(zhì)上（如玻璃或石英平面、微粒等）的一系列微小特征序列（通常為DNA探針）的集合，可被用于定性或定量檢查樣品內(nèi)核酸分子的成分 。
首先，課程會從芯片原理到制備步驟，較為全面詳細地介紹了Thermo Fisher Affymetrix（賽默飛昂飛）、Illunima（因美納）和Agilent（安捷倫）三大生信平臺表達譜芯片的特點、芯片制備、檢測基本原理與步驟，以及常見的表達譜芯片 。
1.Affymetrix芯片
2.Illunima芯片
3.Agilent芯片
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