冬季綠萍致死的主要原因是低溫、冰雪與冷風 。因此，在冬季出現低溫、冰雪的地區都需采取相應的保溫防凍、甚至增溫措施，保護萍體安全越冬，以確保翌年春繁秋種 。越冬保萍方法有濕保和于保兩種，即水面放養保溫越冬和鮮萍堆藏越冬 。而水面放養保溫越冬又分人工保溫床越冬和自然水面（溫泉、工業無毒廢暖水）越冬 。
人工保溫床越冬的方法很多，以塑料薄膜覆蓋萍床為最常見，保萍效果亦好 。一般11月底陸續入床，放萍量為每平方米700-1000克 。放萍后要保持水質清潔，注意治蟲防苔，嚴冬時節晚間需增加覆蓋物保溫防凍 。若床溫較高 ， 綠萍增殖，可適施磷、鉀肥 。溫度高于25℃時，要揭膜通風降溫，以防熱害 。自然水面越冬的管理基本上與萍母田相似 。
【種植綠萍如何越冬保萍】鮮萍堆藏越冬 。主要是利用萍體與微生物在冬季低溫條件下代謝弱的特點 ， 采用疏松堆積法保存種萍，避過寒冬 。在管理上 ， 堆溫（尤其是人堆后一周左右的堆溫）的控制是堆藏保種成敗的關鍵 。正常堆內溫度應為3-5℃，防止冰凍和l0℃以上的堆溫出現 。若堆溫超過l0℃，應通風降溫，或趁天氣回曖時，在自然水面放養，至寒潮來臨前再次撈起堆藏 。但次數不能多 ， 以免影響成活率 。
