連云港港澳通行證辦理流程如下：
1.提交申請
申請人可先在網上提前預約申請（預約入口點此進入），或直接到現場提出申請，并按照規定填寫《中國公民出入境證件申請表》 ， 準備好需要提交的相關證明材料 。
2.數碼照相
申請人需要提交本人數碼照片兩張，可直接在現場進行拍照(亦可在公安局認可的拍照點拍照 ， 需領取照片回執) 。
3.采集指紋
申請人在工作人員的指引下進行指紋采集或者核驗指紋(左右手大拇指)，16周歲以下的申請人是否采集指紋根據其監護人的意見確定，采集后拿號等待辦理 。
4.受理申請
工作人員對申請人提交的材料進行初審，并出具繳費單給申請人(如果申請人希望使用免登記自助通關，應同時簽署《免登記使用港澳地區自助查驗通道聲明》) 。
5.繳納費用
申請人到指定窗口繳納辦證及簽注所需的費用，制證費用80元，簽注費用以簽注類型而定，并領取回執單 。
6.制作證件
受理申請后，由省公安機關出入境管理機構負責制作電子港澳通行證，并將制作好的證件送回接受申請的出入境管理機構 。
7.發放證件
申請人在制證完成后，到辦理的出入境管理機構領取證件;若選擇快遞形式收件的話 ， 只需等候快遞人員上門進行簽收即可 。
連云港居民辦理港澳通行證需要準備以下材料：
1、近期免冠照片一張以及填寫完整的《中華人民共和國出入境通行證申請表》(以下簡稱申請表);
2、居民身份證;在居民身份證領取、換領、補領期間，可以提交臨時居民身份證;
3、未滿十六周歲的，還應當由其監護人陪同，提交其監護人出具的同意出境的意見、監護人的居民身份證或者戶口簿、護照;
4、國家工作人員還應當按照有關規定，提交本人所屬工作單位或者上級主管單位按照人事管理權限審批后出具的同意出境的證明;
5、從事邊境貿易的，提交在邊境地區市場監督管理部門登記注冊的經營者出具的相關證明材料;
6、從事邊境旅游服務的，提交所在的經國家旅游主管部門批準的邊境旅游組團社出具的證明材料和本人導游證;
【連云港港澳通行證辦理流程 連云港辦理港澳通行證需要什么證件】7、因國籍沖突、港澳居民來內地遺失證件等情形需申請出入境通行證的，應提交有關證明材料 。
