二者在住院報銷方面有所差別：
【農村合作醫療一檔和二檔的區別 農村合作醫療一檔和二檔的區別是什么】(一)一檔繳費的，在實施基本藥物制度的一級醫院發生的住院醫療費用按80%支付(基本藥物按90%支付) ， 在未實施基本藥物制度的醫院住院的按60%支付;二級醫院按58%支付;三級醫院按45%支付 。
(二)二檔繳費的，一級醫院按85%支付(基本藥物按90%支付)，二級醫院按70%支付 ， 三級醫院按60%支付 。
二者在住院報銷方面有所差別：
【農村合作醫療一檔和二檔的區別 農村合作醫療一檔和二檔的區別是什么】(一)一檔繳費的，在實施基本藥物制度的一級醫院發生的住院醫療費用按80%支付(基本藥物按90%支付) ， 在未實施基本藥物制度的醫院住院的按60%支付;二級醫院按58%支付;三級醫院按45%支付 。
(二)二檔繳費的，一級醫院按85%支付(基本藥物按90%支付)，二級醫院按70%支付 ， 三級醫院按60%支付 。
