成分不同低聚果糖又稱寡果糖或蔗糖三糖族低聚糖，是以蔗糖為原料，由1～3個果糖基通過β(2—1)糖苷鍵與蔗糖中的果糖基結合生成的蔗果三糖、蔗果四糖和蔗果五糖等的混合物 。
低聚半乳糖是乳糖作原料，在高濃度下用酵母或霉菌的β -半乳糖苷酶即乳糖酶的催化而生成的低聚糖，其主要成分為一種三糖 6-半乳糖基乳糖，β -半乳糖苷酶可催化乳糖之水解反應，在高濃度底物存在下也催化乳糖的轉移反應，轉移反應的產物是雙糖(半乳糖基半乳糖)，三糖和分子再大一些的低聚糖 。
【低聚果糖和低聚半乳糖的區別】
低聚半乳糖其甜度為蔗糖的 20%- 40%，熱穩定性良好，在酸性下很穩定，粘度接近蔗糖，有較好的保濕性，食品工業將它大量用于奶粉中，還加于乳制品，冷飲、糖果、營養口服液中 。
功效不同低聚果糖，最引人注目的生理特性是它能明顯改善腸道內微生物種群比例，它是腸內雙歧桿菌的活化增殖因子，可減少和抑制腸內腐敗物質的產生，抑制有害細菌的生長，調節腸道內平衡;能促進微量元素鐵、鈣的吸收與利用，以防止骨質疏松癥;可減少肝臟毒素，能在腸中生成抗癌的有機酸，有顯著的防癌功能 。
低聚半乳糖是人體腸道中雙歧桿菌、嗜酸乳酸桿菌等有益菌極好的營養源和有效的增殖因子，可以改善人體腸道的消化吸收功能 。新生兒的消化功能比較薄弱，所以嬰幼兒奶粉中都添加了低聚半乳糖的營養成分 。
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