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褐藻和綠藻顏色不同，出現的時間也不同 。褐藻通常是褐色的，在養魚的早期容易出現 。水中氨氮含量比較高，光照不夠，所以這種藻類容易生長 。但是綠藻的情況就不一樣了，主要吸收硝酸鹽 ， 對光有一定需求 。因此，魚養得越久，綠藻就會越多 。
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綠藻多見于淡水，常附著於沉水的巖石和木頭，或漂浮在死水表面;也有生活於土壤或海水中的種類，浮游種類是水生動物的食物或氧的來源 。
【為什么魚缸里長褐藻不長綠藻 褐藻和綠藻的區別】
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綠藻的葉綠體被兩層細胞膜包圍著，所以有猜測說它們可能是直接由藍菌的內共生而得來的 。部份藍菌有類似的色素沉著 ， 但這似乎出現不只一次，而綠藻的葉綠體也不再被認為和此類型的關系相近 。相對地，綠藻可能和紅藻有著相同的祖先 。
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褐藻沒有單細胞，全為多細胞植物，最簡單的是由單列細胞組成的分枝絲狀體 。進化的種類 ， 有類似根、莖、葉的分化，有的甚至具有氣囊構造，如海帶目可協助藻體漂浮在海面上，內部組織則有表皮、皮層及髓部之分化，體型普遍較為粗大，可長至60多公尺長，大量繁殖時形成海洋森林或藻海，吸引無數海洋生物匯集，帶來豐富的海洋資源 。
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