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微生物肥料是生物制品 ， 生產微生物肥料的原料也是農副產品和天然的物質 。用于農田的微生物肥料中的菌株都是來自于自然界，并且是用科學的方法選出的 ， 對人畜禽植物都沒有致病性的微生物 。微生物肥料產品中的載體大多選自無公害的農副產品 ， 經過發酵腐熟施入土壤中會全部降解，沒有任何殘留 。
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微生物肥料是有利于大自然良性物質循環的可持續發展的肥料，微生物肥料具有提供或活化養分功能、產生促進作物生長活性物質能力、促進有機物料腐熟功能、改善農產品品質功能、增強作物抗逆性功能、改良和修復土壤功能6方面的功能 。微生物肥料完全可以用于有機農產品種植 。
【微生物菌肥的作用與使用方法 微生物肥料沒有任何殘留】
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作為微生物肥料主體的各種菌體在田間發揮作用后，特別是在作物采收后 ， 大部分都死亡降解 。這也是微生物肥料并不是一施永益，應該連年使用的原因 。有機農產品種植對環境、土、肥、水，乃至風向都有一定要求 。有機農產品論證部門也贊成使用微生物肥料 。
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