王康說，國家植物園設立在北京，至少有三重考量，首先是國家形象的象征；其次考慮到科普需要，“北園”每年有400萬人次客流量；再次，設在北京的國家植物園是收集、保存北溫帶代表性植物的較為理想之地，此外還有中科院植物研究所這支“國家隊”的加持 。
許再富在多篇文章中提到，中國的植物園與植物多樣性分布存在嚴重失調，物種越豐富的地方，分布的植物園反而越少 。中國植物園的發展主要集中在中部、東部沿海發達地區的一些大、中城市，投資動輒上億元，甚至十多億元 。而在生物多樣性越豐富和生態環境越獨特的地方，只有極少量的或沒有植物園 。國家第一批重點保護植物中約20％沒被遷地保存的植物，絕大多數就分布在高山、亞高山、寒帶、寒溫帶，以及在干旱、半干旱地區等 。這也是第一批重點保護植物保存率徘徊在80％左右的原因之一 。
世界范圍內，植物園的分布格局也存在類似問題 。歐美和北美分布植物種類有2.8萬種 ， 不到世界總植物種類數1/10，卻建有約900個植物園，約占世界總數一半 。而在經濟欠發達的南美洲，分布有9萬種植物，只有近100個植物園 。
許再富認為 ， 真正從科學意義和遷地保護的角度來看 ， 考慮到生境和昆蟲、鳥類等傳粉等問題，植物園選址應遠離大城市，選擇物種豐富的地方，最好靠近某一自然保護區或靠近大面積自然植被 。這樣就可以將就地保護、遷地保護以及引種回歸自然相結合，且可以避免因生態環境差異太大和人為措施干預過多而產生的“風土馴化”和“人工馴化” 。
1959年 ， 由植物學家蔡希陶領導 ， 在地處滇南西雙版納熱帶叢林“葫蘆島”上創建西雙版納熱帶植物園 ， 是中國面積最大、收集物種最豐富、植物專類園區最多的植物園，也是國內首個露地栽培植物種類超過萬種的植物園 。
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2021年10月3日，游客在北京植物園觀賞植物 。圖/視覺中國
此次在北京設立國家植物園，有人也提出了北京緯度偏高，戶外可栽培并生長良好的植物種類有限的質疑 。對此 ， 王康解釋說 ， 剔除品種，僅就物種而言，國家植物園南、北園收集、保存的植物種類達幾千種 。未來，國家植物園將遷地保護東北、華北和西北即“三北”地區及國際上同緯度地區、相似氣候類型的植物 。一些無法露地栽培的植物，將置于溫室或在北京郊區、適合植物生長的地方設立實驗站 。
許再富表示，露地是植物遷地保護的主要場所 ， 溫室只能是一個輔助性的措施，更多起到科普展示的作用，難以真正實現生物多樣性保護的目的 。“北方溫帶植物的多樣性還是相對比較貧乏 。”一位業內專家分析說，設立于北京的國家植物園定位應以露地栽培北方植物為主，如果建大面積的溫室，也將帶來巨大的花費 。
全球植物園中 ， 并不乏設立在首都的案例 。許再富解釋說，這是因為早期在歐美國家，植物園并沒有承擔生物多樣性保護的功能 。另外 ， 隨著城市化的進程，原本建設植物園的郊區變成了城區，這是由客觀原因造成的 。
按照國家林草局的規劃，除了在北京設立國家植物園，今后還將在廣州等地建設區域國家植物園 。國家植物園體系建設將采取整合與新建相結合方式，以代表典型氣候帶和典型植被特征的區域國家植物園為主體的構架 。
中國的植物園大多建在城市中，面積較小 ， 也是限制對植物遷地保護的重要因素 。根據許再富等人2008年對于全國120多個植物園的統計，面積在40公頃以下的小型植物園占總數的40％，超過100公頃的植物園占1/3左右 。所有植物園中，相當一部分為城市公園性質 。“城市中面積很小的植物園 ， 不必承擔生物多樣性保護的任務，主要行使科普職能 。”許再富說 。此次國家植物園建設，按照規劃 ， 將把“北園”北側山林納入，使得植物園總面積達到近600公頃 。
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