房租個稅扣除標準有三檔，南京屬于省會城市，扣除標準為1500元 。
【南京住房租金專項附加扣除標準有幾檔】扣除標準：
①直轄市、省會城市、計劃單列市以及國務院確定的其他城市，扣除標準為每月1500元 。
②除了以上城市，市轄區戶籍人口超過100萬的城市，扣除標準為每月1100元 。
③市轄區戶籍人口不超過100萬的城市，扣除標準為每月800元 。
扣除方式：定額扣除
扣除主體：
1.夫妻雙方主要工作城市相同：只能由一方（即承租人）扣除；
2.夫妻雙方主要工作城市不同，且各自在其主要工作城市都沒有住房的：分別扣除 。
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