1、寄生：草蓯蓉寄生在凱木屬物根上 ， 肉蓯蓉寄生在沙漠樹梭梭根上 。2、分布：草蓯蓉分布在朝鮮、日本和中國的陜西等地 ， 肉蓯蓉主要生產于新疆等 。3、外形：草蓯蓉株整體接近無毛 ， 肉蓯蓉高大 。4、花色：草蓯蓉暗紫色或暗紫色 ， 肉蓯蓉淡黃白或淡紫色 。5、環境：草蓯蓉喜陰暗潮濕地 ， 肉蓯蓉喜輕度鹽漬化地 。
一、寄生不同
1、草蓯蓉經常寄生在凱木屬物根上 。
2、肉蓯蓉是沙漠樹梭梭根寄生的寄生植物 ， 從梭梭寄生主中吸收養分和水分 。素有沙漠人參的美稱 ， 具有極高的藥用價值 ， 是中國傳統珍貴的中藥材 。
二、分布不同
1、草蓯蓉分布在朝鮮、日本、俄羅斯（西伯利亞）和中國的陜西（陜北）、黑龍江、吉林和內蒙古 。生長在海拔1500-1800米的山坡、林下低濕度和河邊 。
2、肉蓯蓉主要生產于新疆、內蒙古阿拉善盟 ， 甘肅、寧夏也分布 。
三、外形不同
【肉蓯蓉與草蓯蓉的明顯區別在哪? 草蓯蓉與肉蓯蓉有什么不同】1、草蓯蓉株高15-35厘米 ， 整體接近無毛 。根莖橫行 ， 圓柱狀 ， 通常有2~3根直立莖 。
2、肉蓯蓉是一種高大的草本 ， 高40-160厘米 ， 大部分地下生 。莖不分枝或自基部分為2~4根 ， 下部直徑為5-10（-15）厘米 ， 向上逐漸變細 ， 直徑為2~5厘米 。
四、花色不同
1、草蓯蓉花冠寬鐘狀 ， 暗紫色或暗紫色 ， 筒膨大成囊狀 ， 上唇直立 ， 接近頭盔狀 ， 長5~7毫米 ， 邊緣短 ， 下唇極短 ， 3裂 ， 裂紋三角形或三角形披針形 ， 長2~2.5毫米 ， 往往向外折疊 。
2、肉蓯蓉的顏色有變異 ， 淡黃白或淡紫色 ， 干后經常變成棕色 。
五、環境不同
1、草蓯蓉喜歡陰暗、潮濕、低溫的環境條件 ， 沒有這樣的環境條件是沒有草蓯蓉分布的 。
2、肉蓯蓉喜生于輕度鹽漬化的松軟沙地 ， 一般生長在沙地或半固定沙丘、干枯老河床、湖盆低地等 ， 生境條件差 。適合生長區的氣候干旱 ， 降雨量少 ， 蒸發量大 ， 日照時間長 ， 晝夜溫差大 。土壤以灰色沙漠土、沙漠土為主 。
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