1、某省 ， 清水市，深夜，一群歹徒瘋狂地砸毀了個體司機的車輛，然后揚長而去 。面對歹徒的挑釁
2、受害者的質問，派出所民警顯得無能為力，無所作為 。年輕的警官林蔭臨危受命，被任命為新的清水市公安局長 。林蔭肩負使命，走馬上任 。赴任途中，他親眼目睹一伙惡徒圍毆個體司機 。一番搏斗之后，林蔭抓住了三個行兇的壯漢，另有一人逃竄 。
3、林蔭下令嚴懲三歹徒并追捕逃跑者 ， 打響上任第一炮 。然而，副局長牛明曖昧的態度，派出所長趙鐵軍放跑歹徒的行徑無疑給了他一個下馬威 。就在這一片紛亂中，林蔭見到了前來迎接他的方政委、周副局長和黎副局長等人 。
4、不久 ， 一天夜里 ， 市委萬書記等領導的辦公室被盜 ， 值班員被殺，竊賊逃逸 。萬書記大發脾氣 ， 指責公安局失職 。林蔭立下軍令狀，表示一個月內破案，如果不破，就地辭職 。何大來突然來到清水，授意市人大常委、光華公司董事長鄭光軍在最豪華的“皇朝大酒樓”擺下宴席，宴請林蔭 。席間 ， 酒樓女經理陶素素那哀怨的歌聲讓林蔭覺得似有深意，遂對她的來歷產生了興趣 。秦志劍對林蔭與何大來、鄭光軍等人的交往產生了誤解 ， 向林蔭提出辭職，林蔭大感詫異 ， 堅持挽留 。
5、秦志劍將自己對鄭光軍一伙人的調查情況全盤托出，林蔭終于看清了清水黑勢力的源頭 。從此 ， 林蔭依靠以秦志劍、高翔為代表的廣大正直的公安干警，在陳副書記、洪市長、方政委等人的支持下，與以鄭光軍為首的黑惡勢力和公安隊伍內部的腐敗分子展開了殊死搏斗 。正在林蔭為工作經費緊張發愁時，局辦公室副主任郝正突然找到林蔭，說市財政局管局長能通過省財政廳的一位處長幫公安局要來錢 。處長提出的條件就是要林蔭準許他的朋友來清水開賭城，林蔭怒不可遏 ， 斷然拒絕 。但是處長的話讓林蔭想起清水就有一個大賭場，那就是鄭光軍經營的皇朝大酒店 。
【使命電視劇劇情】6、林蔭早就想打掉它，現在又多了一個理由，那就是通過沒收賭資和罰款，解決經費問題 。林蔭制定了一個周密的行動計劃代號“雷雨行動” 。“雷雨行動”產生了很大的反響,何大來、萬書記都插手干涉“雷雨行動”，從陳副市長口中林蔭了解到陶素素是萬書記的人 。屢遭打擊的鄭光軍等人鼓起最后一點勇氣，勾結腐敗分子 ， 向林蔭發起反撲 。在他們的誣告之下，地區政法委和紀檢委聯合調查組來到清水，調查清水公安局的問題，也就是林蔭的問題 。調查組一無所獲 ， 很快撤出 。地委的態度令鄭光軍一幫人不知所措 。他又去省城請來了省人大趙副主任 。不久就有風言風語傳來，說地委準備調動清水公安局領導班子 ， 林蔭聽后，加快了工作的步伐 。秦志劍帶領黃建強和高翔秘密登上南下的列車，去廣州抓捕赫剛和二軍子 。在廣州 ， 二軍子開槍拒捕，黃建強犧牲 。
7、二軍子和赫剛趁亂逃走，但他們的兩個同伙薛懷禮和李大興被捕，承認了貪污和陷害徐子民的犯罪事實，說出牛明當初參與制造了徐子明錯案 。已在獄中服刑的盜竊犯沈勇突然要見林蔭，林蔭和方政委連夜趕到監獄，詢問沈勇 。沈勇說市委大樓那個案子，他隱瞞了許多事實：僅僅在萬書記辦公室光現金就拿到十萬，還有好幾個存折，加起來有300多萬 ， 還有好幾個案子，都有這種情況 ， 但是在審問時自己都少說了，是牛明讓他這么做的 。林蔭和方政委聽得目瞪口呆，幾乎難以相信 。除夕之夜，公安局舉辦迎春團拜會，林蔭致辭，向干警們表示感謝，并與大家說再見，希望大家保重 。然而 ， 一場決戰悄悄展開 。林蔭等人押送二軍子的車隊遭到赫剛等歹徒的攔截 。一場激烈的槍戰展開，高翔身負重傷 ， 依然用自己的身體壓住了赫剛 。二軍子跑向同伙 ， 卻被同伙擊斃 。高翔犧牲在林蔭的懷里 。陶素素死后，在她的遺物中，發現了一個日記本，上面記載了她所知道的鄭光軍的每一件壞事 ， 以及鄭光軍和萬書記的關系，時間、地點，清清楚楚 。萬書記被 “雙規” ， 不情愿地離開了清水 。同時，牛明被地區檢察院法紀科請去，再也沒有回來 。地委決定林蔭繼續擔任清水公安局長職務 ， 并兼任白山地區公安局副局長 ， 谷局長再一次送林蔭到清水 。通往清水的山路上，他們乘坐的吉普車飛快地駛向遠方 。
