股東證明持有股份方式：公司章程、工商登記、股東名冊、有關股東出資的證明文件、出資協議或股權轉讓協議、實際出資、實際享有股東權利、承擔股東義務等方法 。
法律依據：
《中華人民共和國公司法》第三十一條
【公司股東怎么證明股份 怎么出有公司股份的證明】有限責任公司成立后 ， 應當向股東簽發出資證明書 。
出資證明書應當載明下列事項：
（一）公司名稱；
（二）公司成立日期；
（三）公司注冊資本；
（四）股東的姓名或者名稱、繳納的出資額和出資日期；
（五）出資證明書的編號和核發日期 。
出資證明書由公司蓋章 。
