那么 , 這只“智能線蟲”究竟長啥樣?
首先,團隊利用大量公式和模型,建模出線蟲的“電子神經元” 。
用到的模型主要有三種:多種離子通道模型、Hodgkin-Huxley模型和多艙室(多房室)模型(Multi-compartment Model) 。
其中,多種離子通道模型顧名思義 , 用于模擬細胞膜上的各種離子通道,天寶 1.0模型使用了14種離子通道;
Hodgkin-Huxley模型(HH模型) , 能將神經元的每個部分都模擬成不同的電路元件;

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△HH模型示例,圖片來源于維基百科—真·生物是一臺精密的電子儀器
多艙室模型 , 將神經元視為一個系統,按動力學特點分為若干個艙室,每個艙室所包含的離子通道數目也各不相同 。

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△圖片來源于江小芳, 劉深泉, 張煦晨著論文《中等多棘神經元的多房室模型分析》
這三種模型組合起來,就能將神經元的構造、神經元細胞膜上動作電位和梯度電位的形成與傳導、以及物質在各機體部分間傳導的速率模擬出來 。
施工完成后的這只“智能線蟲”,精細建模了秀麗隱桿線蟲(雌雄同體)的302個神經元、以及這些神經元之間的數千個連接,使用了14種離子通道 , 細節達到了亞細胞級別 。
線蟲的302個神經元分為感官神經元、中間神經元和運動神經元等,在這其中,團隊又針對106個感知和運動神經元進行了高精度建模 , 高度擬合了它們的電生理動力學 。
統計下來,單個神經元最多艙室(compartment)數2313個 , 最少10個 。302個神經元平均每個52個艙室 。神經元之間的突觸連接精細到神經突(樹突、軸突)的水平:

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然后 , 團隊構造了一個3D流體動態仿真環境,讓線蟲在接近真實的場景下運動起來 。
注意 , 模擬環境這一步尤為重要,它是研究線蟲如何自適應微觀環境運動方式的關鍵步驟 。
線蟲建模精細到亞細胞(微米級別)后,物理定律的尺度都縮小了,摩擦力與粘滯力的作用要比重力大上幾個數量級 。
在這種情況下,線蟲還能自如地吃飯喝水供能,與其和環境交互的巧妙方式密不可分 。
因此,天演團隊結合計算神經學、運動力學、圖形學等多學科交叉,為智能線蟲“天寶”構造了逼真的線蟲肌肉和身體軟體模型,建立了更適合人工智能體訓練的流體仿真環境 。
具體來說,這個環境框架由包含三維建模、有限元求解、簡化流體模型、強化學習、可視化等多個模塊 , 能最大程度上模擬線蟲與環境的交互方式 。
相比目前國際領先的OpenWorm線蟲仿真項目,天演團隊的流體仿真環境規模更大,也更適合作為生命體的多體/群體智能行為仿真環境、完成智各種能體學習訓練復雜任務等 。
最后,團隊將線蟲模型放到仿真環境中,完成了初步訓練 。
這些都是未來天演平臺的組成部分 。具體來說,這是一個還在建造中的多GPU集群平臺,可用于高精度、大規模生物神經元的模擬 。
在場景尺度超過1300個線蟲身長的仿真環境下,團隊現在已經初步訓練出了能夠根據環境化學信號分布自主行動的“智能線蟲”,而這一場景也能支持更大空間和多線蟲群體仿真 。
據團隊表示,“智能線蟲”模型能夠高效、精準地計算與流體環境相互作用的規律,在相同計算資源下,單線蟲單次仿真時間小于0.1秒 。
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