種菇實際上是培養菌 。菌有好菌，也有壞菌 。好菌是對人類有益的菌，如菇能給人以營養；壞菌是對人類有害的菌，如雜菌，它們不但會致菇死亡，給生產造成損失；有的還能危害人體健康，使人得病，甚至危及生命 。為此，必須做到：
(1)嚴禁將食品帶進種菇現場，邊工作，邊吃東西 。
(2)接種、掏瓶、倒袋、噴藥及進菇房作業時，要戴口，罩 。向高處噴藥時還應戴墨鏡，并嚴禁在工作過程中嘻笑言談 。
(3)進行熏蒸滅菌時，必須按操作要求，嚴加個人防護，熏后待藥昧散盡再進去工作 。
(4)配制或使用有腐蝕性的藥劑時，要防止損壞衣物及燒傷皮膚，最好帶上乳膠手套工作 。
【種菇過程中應注意哪些個人衛生 種菇流程】(5)勿在紫外線燈照射下工作，更不能直視開著的紫外線燈管，其對眼粘膜及視神經有嚴重損傷作用 。
(6)對爛菇、碎菇及生了病、蟲的菇，不要輕意揀回去吃 。
(7)嚴禁在菌絲培養室及菇房休息，玩牌，或住宿 。
(8)離開種菇現場回家休息時，要更換衣帽，或清掃衣服，并洗手、擦臉和漱口 。
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