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三聯法治療三聯法治療幽門螺旋桿菌主要是根據病情適當的使用胃粘膜保護劑、促進胃排空藥物、抗膽堿類藥物以及抗菌類藥物 。
抑制胃酸藥物：有質子泵抑制劑和組胺H2受體拮抗劑，這類藥物主要可抑制胃酸分泌 ， 促進潰瘍病愈合 。因此，服藥期間宜在飯前半小時，組胺H2受體拮抗劑睡前服藥可抑制夜間胃酸分泌高峰 。這種抑制胃酸的藥物一般維持用藥三個月左右 。
抗菌類藥物：克拉霉素、阿莫西林、甲硝唑 。此類藥物具有抗幽門螺桿菌作用 。因空腹服用可以引起胃部不適，宜于飯后半小時服用 ， 用藥時間是一至二周 。
胃粘膜保護制劑：這類藥物主要是保護胃黏膜，使其免受胃酸劑胃蛋白酶的刺激，從而促進潰瘍的愈合，故在飯前半小時和睡前半小時服用最佳 。也可按需要服用，但因含金屬成分而不能連續服用兩個月以上 。
四聯法治療四聯療法主要是由于在三聯療法的治療上很多幽門螺旋桿菌具有了一定的抗藥性 ， 需要使用一些新藥來增強抗菌作用，因此，四聯療法主要在在三聯療法的基礎上添加一些抗菌藥和胃粘膜保護藥 。
序貫療法序貫療法在目前醫學界還沒有給出明確的定義，其主要是利用半衰期長生物利用率高的抗菌藥物的口服制劑代替靜脈注射制劑進行治療的一種方法，這種方法的特點是用藥時間長，而且需要是有多種抗菌藥的轉換使用，非醫學專家不宜使用 。
幽門螺旋桿菌的防治【幽門螺旋桿菌的治療】在醫學家的眼里，這種人類感染率超過半數的菌類是很好徹底消滅的 ， 90%的細菌感染者經過1～2周治療后，體內的幽門螺桿菌往往能被消滅殆盡 。他們建議，應當進行全民普查，至少應該對接受過胃部手術、有過胃病、或親屬中有過胃癌的人進行幽門螺桿菌的檢查 ， 并對感染者進行殺菌治療，這樣有望控制胃癌 。飯前便后洗手，講究個人衛生是預防幽門螺旋桿菌的有效方法 。
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