1、抵扣不同：增值稅專用發票可以抵扣進項稅，普通發票不可以抵扣進項稅 。這是他們最主要的區別，后面聯次、內容的區別都是基于此產生的；
2、聯次不同 。專用發票有四聯，包括開票方用于留存備查的存根聯、用于購買方記賬的發票聯，用于購買方扣稅憑證的抵扣聯，用于銷售方記賬的記賬聯 。普通發票不能抵扣，所以沒有抵扣聯，只有其他的三聯；
3、使用主體不同 。專用發票一般使用主體為增值稅一般納稅人 ， 一般情況下，不包括小規模納稅人，小規模納稅人只能經稅務機關批準后由當地稅務機關代開；普通發票是未辦理稅務登記的納稅人也可直接向稅務機關申請領購使用；
【增值稅票和普票的區別 增值稅票和普票有哪些不同】4、發票的內容不同 。專用發票除了包括普通發票所具備的內容外，還包括增值稅方面的內容 。
