選種與選育是提高種鴕鳥品質、增加良種數量及改進鴕鳥產品質量與擴大優質產品額的重要工作 。選擇的作用在于能定向地改變種群的基因頻率，從而改變生物類型 。而基因頻率的定向改變，歸根結底是由于打破了繁殖的隨機性和群體基因頻率的平衡狀態，以達到改變種群中質量性狀各種類型的比率和數量性狀的全群平均水平 。
（一）成鳥的選擇
作為種鴕鳥必須有優秀的生產性能而沒有遺傳缺陷 。因此，除參考系譜外（但有些場的系譜有時不全）主要是通過外貌特征和生產性能加以選擇 。
1．根據外貌特征進行選擇
總體要求是外貌結構良好，體大健壯，生長發育正常，性情溫順，活潑好動 。具體要求：母鴕鳥頭細清秀，眼大有神、頸粗細適中，不彎曲 。體軀長寬而深，呈橢圓形，腰脊微龜背形，不彎曲，不過肥，也不過瘦 。羽毛光潔而潤澤，覆蓋均勻 。肢形正常，長短適中，強壯有力 。公鴕鳥要求頭較大，眼大有神，頸粗長，體軀前高后低，有雄像，腿前后均紅，喙紅，眼圈紅，泄殖腔周圍紅，生殖器大而紅 。
2．根據生產性能進行選擇
【鴕鳥的種鳥的選擇方法 如何挑選鴕鳥幼鳥】優秀的母鴕鳥一般隔一天產一枚蛋，連產20多枚休息6-12天，一般4歲以上的母鴕鳥，年產蛋應在80枚以上且無生殖道疾病，所產蛋的表面光滑，蛋形正常 。優秀的公鴕鳥配種次數多，一般日配超過6次，這種雄鴕鳥性欲旺盛，種蛋的受精率高，沒有遺傳缺陷 。
（二）幼鴕鳥的選擇
根據幼鴕鳥的系譜和生長發育情況加以選擇，選擇系譜清晰，近交系數低，母鳥產蛋性能高，種蛋受精率高，幼鳥自身生長速度快，發育好，外貌特征符合品種要求，無畸形無缺陷者 。
外地選購小鴕鳥時，更應嚴格考查近交程度，避免造成近交退化現象 。最好從二個場選購小鴕鳥，可有效地避免近親交配 。由于母鴕鳥的性成熟時間比公鴕鳥早半年至一年，因此，選購或組群時一般要求公鴕鳥的年齡比母鴕鳥的年齡大6--10個月 。
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