公積金繳納基數是綜合工資，但實際操作中，許多單位都是依照標準工資來繳納公積金的，主要是為了減輕企業財政負擔，可是這類行為其實是不合法的 。每月公積金繳存額是由職工個人交納和企業為職工交納兩部分構成，其計算方式是以職工上一年度月平均收入為基數和現行政策要求的繳存比例計算得出的 。
公積金繳納比例有幾檔公積金繳納比例有兩個檔次，分別是按照5%的比例繳納公積金，或是按照12%的比例繳納公積金 。其中單位和個人繳納比例是相同，要選12%公積金繳納比例的話，企業和個人的比例都是12% 。住房公積金由兩部分組成，一部分由職工所在單位繳存，另一部分由職工個人繳存，職工個人繳存部分由單位代扣后，連同單位繳存部分一并繳存到住房公積金個人賬戶內 。
什么是公積金繳存比例所謂繳存比例就是指應繳公積金的系數，例如你的工資是100元，應繳公積金的系數是3%,那么你的應繳公積金的數額就是3元 。工資的額度和系數的改變，都會影響到應繳公積金的數額 。
【公積金繳納基數是底薪還是綜合工資】例如：你的基本工資(繳存基數)為2000，公司及個人的繳存比例都是10%，不考慮社保個稅什么的話，那每個月，你領到手的工資就只有1800，有10%是在發工資前繳存到了你的公積金帳戶里，而同時你的單位也要繳存200元到你的公積金帳戶，所以你實際上的收入是2200，但可以自由支配的錢就只有1800，公積金里的400元要因為買樓或租房等原因才能申請出來用 。
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