區別：組織分離制種屬于無性繁殖，而孢子分離制種屬于有性繁殖 。組織分離：將種菇清洗干凈，然后用鑷子夾住放置在培養皿內，使用75%酒精棉球進行消毒，接著使用無菌水清洗3次；清洗后，使用解剖刀在菌蓋與菌柄的交界處，切取0.3-0.5cm的菌肉組織塊，轉移至斜面培養基 ， 置于24℃的恒溫箱中進行培養 。
一、食用菌組織分離與孢子分離制種有何區別
1、區別
食用菌組織分離制種屬于無性繁殖，而孢子分離制種屬于有性繁殖 。
【食用菌組織分離與孢子分離制種有何區別，食用菌組織分離法的優缺點】2、組織分離
（1）選擇肉厚肥大，鮮嫩，出菇早，菌柄較短的食用菌作為種菇 。
（2）將種菇清洗干凈，然后放在接種箱內進行消毒 。具體操作：用鑷子夾住種菇放至于培養皿內 ， 然后使用另一把鑷子夾住75%酒精棉球或者是0.1%升汞棉球，進行消毒，接著轉移至另一培養皿內用無菌水清洗3次 。
（3）使用解剖刀蘸取適量酒精 ， 進行火焰消毒，待刀冷卻后將種菇切開，在菌蓋與菌柄的交界處，切取0.3-0.5cm的菌肉組織塊 ， 轉移至斜面培養基上 ， 置于24℃的恒溫箱中進行培養 。
（4）檢查生長情況 ， 如果分離出來的菌肉組織塊上長出了正常的白色菌絲，說明分離成功 。
3、孢子分離（多孢分離）
（1）選擇朵形圓正，長勢較好，沒有病蟲害，出菇均勻，8-9分熟的種菇 。
（2）切掉種菇的大部分，使用無菌水沖洗菌柄處，然后使用脫脂棉將表面水分擦干 。
（3）使用鐵絲將種菇的菌褶朝下 ， 掛在玻璃漏斗下面 。漏斗倒蓋在培養皿上 ， 上端部分使用棉花將小孔堵住 。
（4）將培養皿放在搪瓷盤上（盤內鋪設紗布），靜置12-20小時后，孢子散落在培養皿上，形成孢子印 。
（5）使用接種針沾取孢子在試管中的瓊脂上進行接種 。等到孢子萌發，生成菌落時，選擇萌發時間早，長勢好的菌落進行培養 。
二、食用菌組織分離法的優缺點
1、優點
（1）食用菌組織分離相較于孢子分離操作更為簡單，成功率更高，后代不容易產生變異 ， 能夠較好的保持菌種的優良性質，防止菌種品性退化 。
（2）組織分離法的適應性較廣，能夠用于絕大多數食用菌制種 。
2、缺點
（1）在多次重復操作過后 ， 容易發生退化 。
（2）組織分離制種很難制出比母體更加優秀的品種 。
（3）在大規模應用與生產之前，需要做品種對比試驗，在確定菌種的優良特性沒有變異后，才能進行繁殖 。
